Politique de la publication scientifique

Les liaisons dangereuses des universités, politiques et éditeurs scientifiques 

[modification le 14.11.2019]

CC0 barbelé

Il n’y a pas beaucoup de secteurs numériques où les européens excellent. Mais dans le domaine de la publication scientifique digitalisée, des éditeurs européens sont des leaders dans le business mondial : Elsevier, Springer-Nature, Taylor & Francis, et nouveaux éditeurs Open Access (OA) Frontiers et Molecular Diversity Preservation International et Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI). L’Union Européenne (UE) fait de sa priorité le marché unique numérique, et vise à faire tomber les barrières réglementaires de 28 marchés nationaux. Le but ? Faire du numérique un moteur de croissance européen. La Budapest Open Access Initiative (BOAI 2002) vise quant à elle le partage universel des connaissances, et Open Science (OS) vise une science collaborative et reproductible.

Ces intérêts contradictoires au sein d’une université, d’une nation ou au sein de l’Europe se télescopent, et les principes de l'OA et de l'OS ne sont pas appliqués à la scientométrie et à la gestion des flux des publications générés par l'exploitation des données des publications. 

Education des médias à Open Science (Partie 2)

Open Science - une opportunité pour le journalisme scientifique

[Publication le 10.10.2019, mise à jour le 15.10.2019]

Articles connexes 
05.10.2019 Les universités suisses ont-elles encore besoin de journalistes?
14.10.2019 Scientifiques, communicants et journalistes: un ménage à trois acrobatique 

Le billet précédent, Science - des choix rédactionnels journalistiques contestables, a montré que des médias réputés tels que la RTS, Le Temps ou la NZZ ont parfois relayé des articles scientifiques douteux. La rédaction par les médias ou les communicants insitutionnels s'éloignent parfois du sens de la source primaire. Ce qui amène l’idée d’une formation à Open Science pour aquérir de nouveaux outils et éviter la propagation de 'flawed ou fake ou junk science', ou de résultats gonflés pour capter leur public.

Le Fond National Suisse (FNS) offre des formations aux médias aux chercheurs depuis des années. A leur tour, les journalistes et communicants institutionnels pourraient être formés à Open Science pour améliorer - la sélection de contenus scientifiques à relayer - et la précision des comptes rendus. 

Une proposition a été formulée sous forme de posters pour swissuniversities Open Science Action Plan: Kick-Off Forum du 17 octobre 2019. Swissuniversities, le FNS, et l'Association Suisse des Jounalistes Scientifiques (ASJS) peuvent s'unir et commencer à s’engager à sensibiliser les journalistes et communiquants institutionnels à Open Science.

PDFs sur Zenodo 

Version anglaise - It's Time

Version française -  Il est Temps

Education des médias à Open Science (Partie 1)

Science - des choix rédactionnels journalistiques contestables

[Publication 30.09.2019]

CC-BY Emmanuel Boutet Coups de foudre sur Saint-Julien-en-Genevois

'Le journalisme scientifique n’a jamais été aussi important' et 'La science doit être mieux traitée', plaide le journaliste Olivier Dessibourg, président de l'Association suisse du journalisme scientifique, journaliste scientifique à Le Temps, et fondateur du site d’information scientifique du nouveau média heidinews. La conseillère fédérale Simonetta Sommaruga renchérit avant la conférence World Science Journalism Conference de juillet 2019 à Lausanne: 'Le journalisme scientifique ne doit pas être le parent pauvre des rédactions'. Mais...

La moitié des 1656 journalistes sondés aux USA admettent qu'ils sont incertains à pouvoir repérer des recherches biaisées, truquées ou fabriquées. Qu’en est-il en Suisse? Depuis 2 ans et demi, j'observe que des médias réputés tels que la RTS, Le Temps ou la NZZ ont parfois relayé des articles scientifiques douteux, qui justifierait l’idée d’une formation à Open Science. Voici quelques exemples de contenus médias contestables; des thèmes de formation sont proposés en italique : 

Enjeux de la publication scientifique

Suivre encore la politique de la production académique!

[Publication 21.08.2019]

A la vigne pour digérer les lectures (CC-BY Karen Vigne en véraison 2) 

De la publication scientifique...
J'ai passé une bonne soirée à la fin de l'été avec une ancienne connaissance. Son intérêt et sa gourmandise pour le sujet de la publication scientifique en Suisse m'ont fait réfléchir...

Plus d'un an de découragement et de perte de sens pour le sujet, sans force pour synthétiser des informations ou des histoires. Et voilà qu'une discussion de bistrot éclaire mes errements sur Twitter ou mes réactions à des institutions ou à la presse romande. Je n'ai pas de facilité à écrire, je suis embrouillée, incertaine, lente, découragée par les réponses terriblement silencieuses des institutions et journalistes. Mais il faut reconnaître que j'aime ça...

Recherche d'emploi: échecs. Recherche de formation: trop cher ou non éligible. Coaching: mangé par la dépressivité. Désorganisation. Finalement, retour à mes tous premiers amours, le plein air en nature. Découverte de l'école et du monde pré-scolaire, entre genou cassé, poumons essouflés. Le sens est revenu peu à peu, grâce aux mains dans la vigne et au jardin, aux chèvres, poules, moutons, et ânesses, et grâce à la manivelle du moulin pour l'huile de noix. En classe et en garderie, au contact des petits et grands enfants si fragiles et si vrais. Un projet de reconversion vers l'éducation à l'enfance et à l'environnement germe lentement, et mes horaires irréguliers me permettent tout de même de lire et réfléchir sur la publication scientifique, à mon niveau de citoyenne.

... à l'information citoyenne...
Sciences citoyennes, cela pourrait être aussi saisir les contours de la publication issue de la recherche fondamentale ou appliquée ou des expertises. L'enjeu de l'Open Access et l'Open Research Data ne se limite pas à l'accès à l'information, il s'étend à la validité de l'information ('fake' et 'flawed' science) des articles primaires, des communiqués institutionnels, et de la presse, qui façonnent l'opinion publique. L'enjeu s'étend aussi aux coûts de la publication scientifique digitale inclue dans l'enjeu mondial de la fiscalité des entreprises digitales, et à l'évaluation des chercheurs et des institutions.

Des sources d'information
Alors voilà, ce matin, au réveil, j'ai saisi le clavier, et sélectionné des sources d'information que j'apprécie sur la publication scientifique, sous-domaine de la politique des sciences.

J'espère que ce partage sera un peu utile, cher lecteur.
Et n'hésitez pas à me signaler vos coups de coeur!
Bonne reprise.

Sylvie Vullioud

Automatic reviewing tool

Are texts and personal data of researchers reused by Elsevier to develop commercial AI reviewing products?

[Publication 13.12.2018]

CC0-Graphicalbrain 

European copyright does not allow Text Mining on scientific articles

For the moment, many subscription journals practice a complete copyright transfer after acceptance of author manuscript by contracts or acceptance of general conditions.

Copyright transfer to publisher in practice means that Text Mining (TM) is only possible where Fair Use exception of copyright applies, such as USA and UK: only for non-commercial purpose. The rest of Europe does not have such disposition: even for researchers working in universities with already paid site licenses for metadata, references and attached abstracts, or full texts of articles, they have to pay licences to perform TM.

Plan S position shows that the current use situation of copyright of scientific articles may not be satisfactory for further research, including TM and Artificial Intelligence (AI) developement. Plan S states that researcher-author of article should retain copyright and apply an CC-BY license, to allow easier re-use of article, as stated in the Berlin Declaration. The copyright reform in EU includes debates on a kind of introduction of Fair Use exception for research purpose. 

PlanS and copyright reform clearly consider TM as a high issue for research. Some persons and groups even think to allow TM for commercial purpose for the benefit of innovation. But to my knowledge, legacy publishers are not supporting introduction of fair use.  

Green Open Access strategy

Liège OA model 

Why should you sign the open letter Pour une science ouverte en Fédération Wallonie-Bruxelles? 

[Publication 20.03.2018]

Green Grass and Blue Sky, CC0

This is a call to Switzerland based (and European) researchers, librarians, archivists, swissuniversities and Swiss National Foundation members to sign the open letter intended for Belgian Parliament

SIGN HERE

POUR UNE SCIENCE OUVERTE EN FÉDÉRATION WALLONIE-BRUXELLES Lettre ouverte aux parlementaires de la Fédération Wallonie Bruxelles dans le cadre de la discussion sur le projet de décret Open Access

DMP-Experimentation animale

Data Management Plan

Inclure les données de l'expérimentation animale à des fins de transparence, validité et reproductibilité?!

[Publication 12.12.2017]

Mettez tous vos oeufs dans le même panier, le DMP! Photo Egg textures CC-BY Lobo

Depuis Octobre 2017, le Fond National Suisse (FNS) exige un Data Management Plan (DMP) lors de la soumission de projets. La transparence de l'expérimentation animale de la recherche pré-clinique devrait être maximale pour une meilleure reproductibilité, validité externe, translation et pour l'application des 3Rs (Refine, Reduce, Replace animal experimentation).

C'est pourquoi un DMP en recherche pré-clinique pourrait comporter les données de l'expérimentation animale.

Ce "DMP modèle" présente des éléments clés qui pourraient y être inclus, dans le cas d'une étude pré-clinique basée sur le test d'une hypothèse, appellée aussi étude de confirmation.

Animal data elements as part of pre-clinical research DMP

Cet embryon de DMP est une sorte de réponse aux documents publiés en 2016-2017, un essai pour participer pratiquement à l'amélioration de la validité de la recherche biomédicale et pré-clinique en Suisse.

• Authorization of Animal Experiments Is Based on Confidence Rather than Evidence of Scientific Rigor  Vogt et al (2016)
• The Researchers’ View of Scientific Rigor—Survey on the Conduct and Reporting of In Vivo Research Reichlin et al (2016)
• No publication without confirmation  Mogil et Macleod (2017)
• Data Management Plan (DMP) - Guidelines for researchers Fond National Suisse (FNS) (2017)
• Experimentaiton animale Académie Suisse des Sciences (SCNAT) (2017)
• Reproducibility in animal research: what else than experimental design? Société suisse pour l'étude des animaux de laboratoire (SGV), Meeting annuel 2017

J'espère que ce modèle inspirera des chercheurs biomédicaux et leur sera utile pour leurs réflexions! 

English translation below...